本发明涉及一种提高物联网拓扑结构鲁棒性能的优化方法，通过在初始化的物联网拓扑结构中选取符合4个节点的网络Motif作为最小操作单元后，并在所有的最小操作单元中选出所有具有可重连接边的最小操作单元分别作为操作单元，并且针对选取的部分操作单元分别多次更改其边连接关系，并且每次更改操作不完全相同，这样得到多个新物联网拓扑结构，且由这些多个新物联网拓扑结构形成一个种群，再通过构建鲁棒性能衡量指标，以利用分布式人工免疫优化算法对形成的该种群内每一个新物联网拓扑结构做优化，将具有最优鲁棒性能衡量指标时所对应的物联网拓扑结构作为最优物联网拓扑结构输出，实现了有效提高物联网拓扑结构抵抗恶意攻击的能力。