本发明公开了一种益生菌保护剂及其制备的微生态制剂和用途，其成分包括：菊粉、竹叶提取物、桔梗粉和桑叶粉。本发明将益生菌与益生菌保护剂混合后可以有效保护益生菌，提高益生菌经过胃和肠道后的存活率与定植率，同时提高益生菌的保存时间，缓解和消除腹泻，调节肠道微生态的平衡，抑制肠道有害菌的增殖，并且可以降低慢性肠炎患者体内的炎症因子水平。