本发明公开了一种用于可信操作系统内核模糊测试的种子生成方法及系统，本发明方法包括：针对输入的系统调用文件L获取其中系统调用之间的依赖关系；根据系统调用之间的依赖关系生成用于可信操作系统内核模糊测试的种子；其中，系统调用之间的依赖关系包括显式依赖关系和隐式依赖关系，显式依赖关系是指一个系统调用的参数是另一个系统调用的结果；隐式依赖关系是指两个系统调用共同使用操作系统内核的某个共享区域。本发明能够有效提高对可信操作系统内核模糊测试的效率，保证可信操作系统的安全性和可靠性，一方面可以为漏洞分析提供依据；另一方面从网络攻防的角度考虑，有助于帮助维护者先于攻击者发现并及时修补漏洞。