本发明公开了结合多源数据的城市居民公共健康影响因素可视分析系统及方法，涉及软件开发技术领域，包括多源数据采集模块、多源数据分析模块、疾病挖掘分析模块和可视化模块，多源数据采集模块用于对体检报告信息和多源民生数据进行采集，多源数据分析模块用于对采集到的体检报告信息和多源民生数据进行分析，疾病挖掘分析模块用于根据体检报告信息和多源民生数据对疾病进行挖掘分析，可视化模块用于对多源数据采集模块、多源数据分析模块和疾病挖掘分析模块获得的数据以可视化的形式展现。本发明能为居民健康监控、疾病科普预防、城市健康管理提供分析依据和平台支持。