本发明公开了一种视觉追踪的脑机接口检测系统，包括高清人脸头像采集与移动模块、EEG信号采集模块、时频特征分析提取与分类模块、统计检验评估标准模块这几个功能模块。该系统根据行为量表评估视觉追踪的过程，选定脑机接口实验范式中的目标刺激与非目标刺激，目标刺激键闪烁同时移动，非目标保持不动。通过目标刺激的移动与闪烁，引导患者选择性追踪该目标头像并保持注意直至目标键从中心移至初始位置，并由ITPC(试次间相位一致性)作为特征进行分类实时输出在线结果，20次在线任务的结果进行统计检验，达到显著水平，则认为患者存在视觉追踪，否则不存在。本发明克服了行为量表和经验检测的对行为响应变化的敏感度不高、评估者主观性太强等缺点。