本发明涉及一种基于荧光相关光谱检测有机溶剂诱导蛋白聚集的药物筛选方法，荧光标记的蛋白在含有有机溶剂的水溶液中产生聚集现象，当待筛化合物与蛋白发生相互作用时，会抑制蛋白在含有有机溶剂的水溶液中产生聚集现象，通过荧光相关光谱检测荧光标记蛋白聚集体的特征扩散时间（扩散系数），获得蛋白与待筛化合物相互作用的强弱信息，从而实现基于有机溶剂诱导蛋白聚集的药物筛选，该方法检测体积小、灵敏度高。本发明可针对常见疾病与突发性疾病的临床药物进行筛选，大大减少药物筛选时间和成本，为药物研发提供了更加简单、快速和普适性强的方法。