本发明公开了一种用于去除柑橘类水果囊衣的装置，包括导流槽、气泡提升部件、扰动部件和酶液循环箱；所述导流槽的输出端设有筛板，所述筛板底部设有转接槽，所述转接槽输出口设有酶液循环箱，所述导流槽内设有气泡提升部件，所述导流槽顶部设有扰动部件。本发明能彻底去除柑橘类水果囊衣且不损伤囊胞，实现酶解条件的智能控制和精准调节，并将生物酶回收实现循环利用，减少生物酶的用量和工业废水的产生。