本发明涉及一种螺栓连接结构固有特性分析方法。包括：S1、从刚度的角度出发推导螺栓的轴向刚度、螺纹副的轴向刚度和被连接件的轴向刚度，将螺栓的轴向刚度、螺纹副的轴向刚度和被连接件的轴向刚度等效为三个弹簧串联的刚度，并基于串联弹簧刚度计算公式得到单螺栓连接结构的轴向刚度；S2、获得螺栓组连接结构的轴向刚度；S3、根据S1和S2，确定影响螺栓连接结构刚度的参数，包括螺栓预紧力F_P、螺栓孔径间隙和螺栓数量n；所述螺栓孔径间隙为螺栓孔直径d_h与螺栓的无螺纹光杆的直径d的差值；S4、采用有限元法建立螺栓连接模型，分析螺栓预紧力、螺栓孔径间隙和螺栓个数对螺栓连接结构的固有特性的影响。