本发明公开了一种浮游生物分层采样装置，涉及浮游生物采样技术领域。该浮游生物分层采样装置，包括固定环，所述固定环的底部固定连接有浅水一型网，所述浅水一型网的底部前侧与后侧固定连接有采集盒，所述采集盒的右侧设置有排水筒，所述排水筒的右侧贯穿采集盒并延伸至采集盒的外部。该浮游生物分层采样装置，在进行采集时先将固定环连接拉绳，将此装置沉入水底，在进行上拉的过程中，水流会通过浅水一型网进行过滤，将浮游生物进行收集，水流的阻力会使扇叶进行旋转，使分层片被限位杆的限位下向下移动，使三个分层片依次进入到采集盒的内部，使分层片进入采集盒的时间不同，达到采集不同深度的浮游生物的目的。