本发明公开了一种悬移质泥沙分层采样装置，包括多组采样组件、第一吊绳和第二吊绳；每组采样组件包括采样筒、设于采样筒两端的端盖、以及用于控制两端的端盖保持打开或自动关闭的控制组件；每组采样组件的采样筒上均连接有套管，套管穿过采样筒的竖直中心，相邻上层的套管的下端贯穿采样筒的底部并设有内凸环，相邻下层的套管的上端穿入相邻上层的套管并设有外凸环；第一吊绳的一端依次穿过各层的套管并固定于最底层的采样组件，另一端连接起吊设备的第一卷扬机，第二吊绳的一端固定于最顶层的采样组件，另一端连接起吊设备的第二卷扬机。本发明能够降低设备高度，缩小设备体积，降低在采样过程中的起吊高度要求，同时便于存放和运输。