本发明公开了一种基于FPGA的集中式交流数据采样同步方法及装置，所述装置包括集中控制器和采集子站，所述集中控制器包括第一CPU和采样同步板，所述第一CPU通过blvds总线与采样同步板相连接，所述采集子站包括第二CPU和交流插件AC，所述第二CPU通过blvds总线与交流插件AC相连接，所述采样同步板通过光口与第二CPU中的光口相连接，所述交流插件AC通过数据blvds与第一CPU相连接，本发明通过在集中控制器设计同步板以及相应同步方法，减少对外部同步装置的依赖，并且通过直接发送采样数据的方法，采集子站可直接使用该采样数据信号进行数据采集，减少程序设计复杂度。