本发明公开了一种生态系统分类样本库构建方法和装置，属于遥感领域。该方法利用历史生态系统类型空间分布数据设定多尺度样本采集窗口，根据样本质量系数自动锁定样本采集窗口；在卫星遥感影像中进行样本采集与基本属性信息标注，利用样本的影像清晰度、样本数量、空间分布等信息优化样本质量，标记样本的生态系统特征属性信息，将采集完成的样本入库管理与更新维护。实现了生态系统分类样本的全自动、多尺度、高精度、规范化的采集建库，实现了样本库的智能扩建与可持续构建。解决了不同尺度生态系统分类解译面临的尺度效应问题，满足了生态系统分类样本多样性与区域性的要求，为生态系统遥感智能解译分类奠定了可靠的样本基础。