本发明涉及安防技术领域，具体涉及一种基于方舱的无人机防控系统。包括无人机防御作战系统、通信指挥系统和机动平台；无人机防御作战系统实现对无人机的侦测、追踪与打击；通信指挥系统与公安特勤/治安通信指挥系统、本地工程技术人员和特警单兵的通信相连接；所述的机动平台上设置有无人机防御作战系统和通信指挥系统。其有益效果在于：本发明通过集成无人机防御作战系统、通信指挥系统和机动平台，以无人机防御作战系统为核心，进行无人机防御作战活动，通过通信指挥系统与公安特勤/治安通信指挥体系的结合，以机动平台为依托，为无人机防控作战活动进行辅助支撑，能够实现指挥节点功能，支持公安特勤/治安以无人机防御为主的各项任务。