一种车载医疗方舱系统，包括：电动升降机构，由四组电动升降机构组成，其中，两组固定于医疗方舱舱体前壁两端框架上，两组固定于医疗方舱舱体后壁两端框架上，用于舱体上下车时的支撑和使用时的调平；医疗方舱舱体，设置于电动升降机构上部且与电动升降机构连通；医疗方舱舱体内设置设备间、观察室、隔离通道以及治疗室以及底盘，底盘上承载电动升降机构与医疗方舱舱体。该医疗方舱系统的车体质心布置合理，可提高车载安全性和爬坡性能；机动灵活、功能完善且环境适应性强；集负压隔离、富氧治疗、ICU救治、高原病、传染病隔离和生物防控为一体，提高了在高海拔和疫区等特殊恶劣条件下的急重症救治水平。