本发明公开了一种冻干瓶盖的制造方法，先制备注塑弹性体颗粒和改性聚乙烯颗粒，备用；然后将改性聚乙烯颗粒投入双色注塑机的1号注射筒内并塑化；将注塑弹性体颗粒投入双色注塑机的2号注射筒内并塑化；而后双色注塑机合模，1号注射筒向模具中注入改性聚乙烯，保压、冷却制得盖体；2号注射筒向模具中注入注塑弹性体，保压、冷却后制得胶塞，并且与盖体为一体结构；冷去开模后取出制得的盖体和胶塞组合体；最后，将铝膜贴附在盖体上表面。本发明通过对改性聚乙烯和注塑弹性体的配方进行调整，使得冻干瓶盖的胶塞能够在‑45℃下保持良好的软度和降低的永久压缩形变，同时盖体与胶塞之间粘结强度大幅提高，保证了盖体与胶塞的连接可靠性。