本发明公开了一种组织效能可视化管理方法及系统，涉及组织效能管理领域，获取历史员工报表数据，并对历史员工报表数据进行分析，得到员工报表分析内容，其中，员工报表分析内容包括单位时间平均员工人数、新进员工率、新进员工留存率、人员流动率、人员流失率、人力总成本、人力成本率、全员劳动生产率、人均营收；根据员工报表分析内容确定影响员工满意度的因素，建立组织效能管理模型，通过组织效能管理模型对影响员工满意度的因素进行计算，得到组织效能管理方案。本发明提出了一种组织效能可视化管理方法及系统，不仅克服了背景技术所提到的问题，而且为未来企业的管理与发展提供了更好的方向。