本发明涉及供电设备技术领域，尤其涉及一种混合动力供电系统及冷藏运输设备，系统包括：壳体，壳体上设置有悬挂结构，悬挂结构用于安装在冷藏集装箱的角件上；壳体内的柴油发电供电机组、高压锂电池供电箱、第一变换器以及控制模块，该柴油发电供电机组和高压锂电池供电箱均连接冷藏集装箱内的制冷机组，第一变化器连接于柴油发电供电机组和高压锂电池供电箱之间，且第一变换器设置有第一接口，通过第一接口从外部交流电源为该高压锂电池供电箱充电；该控制模块，用于控制柴油发电供电机组和高压锂电池供电箱为制冷机组交替循环供电，使得该系统独立于冷藏集装箱设置，且内部采用两种供电模式为制冷机组交替循环供电，提高冷藏机组的运输可靠性。