本发明涉及数据处理技术领域，提供一种大数据清洗方法、系统、存储介质和电子设备，一方面，当判断目标业务数据集合存在缺失业务数据时，直接根据缺失业务数据相关联的业务数据进行填充，既能提高数据清洗效率，还在极大程度上保证了数据清洗质量，另一方面，对第一目标业务数据集合进行去重处理，在去重后所得到的第二目标业务数据的基础进行聚合清洗，进一步提高数据清洗效率，而且，并将每条去重数据的数量关联到相应的清洗后的数据集合中，使用户在调用任一清洗后的数据集合时，能够相应添加去重数据，达到为用户提供更精准的数据支持的目的。