本发明涉及中药药材加工生产技术，尤其涉及一种中药材块茎分离装置。技术问题：石菖蒲块茎由一个主干向两侧延伸多个小分枝，人工处理时需要将石菖蒲块茎的主干和小分枝逐个分离，工作量大，效率低下，并且石菖蒲块茎较为坚硬，长期工作工人的手部酸痛无比。技术方案：一种中药材块茎分离装置，包括有机架、防滑垫和安装板等；机架设有六个；六个机架上表面固定连接有安装板，并且六个机架呈矩形设置。本发明可以对石菖蒲块茎进行分离，还可以将石菖蒲块茎上的套壳进行去除，更好的对石菖蒲块茎进行清理；本发明通过设置压平机构，以挤压的方式，可以将交错的石菖蒲块茎变得平整，便于后续对石菖蒲块茎进行分离。