本发明属于食用菌栽培领域，涉及一种菌棒自动脱袋机，包括：机架、输送装置、脱袋装置和菌棒输出装置，所述机架上设置有输送装置，沿所述输送装置的物料传输方向设置有脱袋装置，所述输送装置的尾部与菌棒输出装置的进料端相连；所述脱袋装置包括：钻孔装置、翻转装置、横向割口、纵向割口、撕裂装置、推送装置。减轻工人劳动强度，整个剥皮过程由机器动作完成，无需人工操作；降低生产成本，实现机器全天运行；提高工作效率，每小时脱袋960棒，大约是人工效率的4倍；保证产品质量，菌棒表层切口深度一致，调整好后不会伤害内部菌丝；消除安全隐患，脱袋过程中菌棒不与人接触，人工只需在脱袋前后收放菌棒。