本发明公开了一种隧道内箱涵的精调测量方法、系统、设备与存储介质，其中方法包括安装于隧道内的若干个待校验箱涵，还包括步骤：获取隧道延伸方向的预设中心线与隧道的设计半径；获取隧道中每个预设横截面上若干个测量点；计算若干个测量点与预设中心线的第一距离；剔除第一距离与设计半径的差值大于预设阈值的所述测量点；根据剩余的若干个测量点计算各个预设横截面的圆心；根据若干个预设横截面的圆心生成实际中心线；根据实际中心线生成各个待校验箱涵的位置坐标及姿态；根据各个待校验箱涵的位置坐标与对应的姿态校验各个待校验箱涵的安装信息。本发明可以生成隧道的实际中心线，并提高隧道中箱涵位置信息校验的精度与效率。