本发明公开了一种影像结构化报告模板的自动生成方法及系统，包括以下步骤：步骤S1、在历史影像报告大数据的表征影像描述的自然语言中提取出定性实体，并对所述定性实体进行重要性统计得到定性实体的重要度，再根据重要度选取定性实体作为定量实体；步骤S2、基于所述定量实体构建结构化的影像数据表格模板，以及基于所述定量实体和影像数据表格模板构建结构化的影像描述语言模板。本发明基于专家经验得到的定量描述的器官组织进行结构化报告模板的构建以实现对医疗影像的定量描述和定性描述，兼顾规范化和结构化表达，同时，将医疗影像进行数据形式的结构化表征有助于对生成的结构化报告进行统计学管理，从而提高检索自动化程度。