本发明公开了一种间接蒸发制冷系统及其控制方法，所述间接蒸发制冷系统包括第一风道、第二风道、供电机构和机械制冷机构，所述机械制冷机构包括第一蒸发器，所述第一风道内设置有热管蒸发器和所述第一蒸发器，所述第二风道内沿着排风方向依次设置有降温除湿机构和热管冷凝器，所述降温除湿机构用于对热管冷凝器内的冷媒进行降温；所述降温除湿机构以及所述机械制冷机构分别与所述供电机构电性连接；本申请公开的间接蒸发制冷系统，采用间接蒸发冷热管配合机械制冷机构，可降低制冷系统的工作能耗；降温除湿机构可降低湿空气对制冷系统的影响，提高热管蒸发器和热管冷凝器的换热效率，降低机械制冷机构的工作负荷，进一步降低制冷系统的工作能耗。