本发明公开了一种基于视觉导航的水田农用底盘无人驾驶系统，包括摄像头、PC端、上位机和下位机；摄像头与上位机相连，用于查看实时画面；PC端作为上位机的显示器，显示摄像头传输过来的界面；上位机集成有一个目标跟踪模块，并通过串口与下位机相连；下位机从上位机接收到的指令控制水田农用底盘；目标跟踪模块是实现水田农用底盘自主导航作业的控制决策核心，其能够框选出目标物，再根据目标矩形框与摄像头的视野正中心作差，得到偏移量的正负，最后利用PID算法根据偏移量的正负来控制水田农用底盘的电动方向盘，且当目标物跟踪失败时，控制水田农用底盘的制动系统。该系统可以减少劳动力，实现水田农用底盘自动转向，提高作业效率。