本发明公开了一种用于低对比度的目标点识别方法及系统，涉及图像处理技术领域。该方法包括：获取待识别图像的步骤；通过差分高斯滤波增强待识别图像的步骤；通过自适应阈值对增强后的待识别图像中的所有像素点进行处理，确定候选目标点的步骤；通过动态聚类方法对全部候选目标点进行聚类的步骤。本发明适用于低对比度的小尺度目标点识别，通过差分高斯滤波增强预设尺度范围内的目标点，使用自适应的阈值策略对目标点进行检测，然后对目标点进行聚类，能够快速地实现低对比度的小尺度目标点识别，识别准确率高，且实现过程简单方便，应用前景广阔。