本发明属于医学影像处理技术领域，公开了人工智能在核素心肌灌注显像中的辅助诊断系统、方法及应用。将标注后的图像放入深度学习网络进行特征提取，从而对辅助诊断模型进行训练；基于特征提取训练完毕后的辅助诊断模型对输入被检测图像进行不同病变位置和不同病变程度进行判断；同时应用改进的分割网络进行靶心图检测，统计出心肌缺血部位的面积占比；将统计后的结果进行可视化显示。本发明通过逐步完善此人工智能网络，以提高其诊断准确性，之后将其拓展到核医学其它检查部位图像的辅助诊断以及推广到云端辅助诊断，为基层医院及检查量大的医院或其他第三方机构提供支持，为核素心肌灌注显像的辅助诊断提供一种全新的手段。