本发明公开了一种基于机器视觉的粪便收集装置及收集方法和应用，通过粪便传送装、机械臂、图像采集装置、粪便采集装置相互配合，完成目标粪便的收集，提高了收集效率，提高了产能，在减少人工参与的同时大大降低了交叉污染的风险，使球虫卵囊的生产需求得到持续稳定的保证。由于目标粪便的完美收集减少了杂质粪便的进入，进一步减少了回收球虫卵囊的时间；在回收球虫卵囊过程中，先用较高浓度硫酸镁溶液进行漂浮球虫卵囊，一是可以提高回收率，二是减少试剂用量，且试剂本身成本较低，从而大大降低成本；再加清水稀释上清液，可以回收卵囊且进一步除去其他杂质，从而提高球虫卵囊的纯净度。