本申请涉及一种云端心电数据处理方法、装置、计算机设备和存储介质。所述方法包括：代理程序接收客户端发送的心电数据处理请求；代理程序部署于云端服务器；代理程序提取心电数据处理请求中心电数据和应用参数；桌面程序接收应用参数和心电数据，根据应用参数查找对应的执行模块，根据执行模块对心电数据进行处理，获得执行结果；桌面程序部署于云端服务器，云端服务器安装与桌面程序兼容的操作系统；代理程序获取执行结果，并发送至客户端。采用本方法能够桌面程序在云端服务器的二次开发成本。