本发明公开了一种连栋玻璃温室屋顶清洗系统，包括清洗机和自动移动装置，清洗机包括支撑架、行走装置、清洗装置、控制箱、电缆卷筒与水管卷筒，所述支撑架跨在人字型玻璃屋顶上，包括左倾斜框架和右倾斜框架，该左倾斜框架和该倾斜右框架的顶部之间通过横梁连接；所述行走装置包括安装在横梁之间的顶部安装箱内的行走轮驱动电机和安装在左、右倾斜框架下端的左、右行走支架，在左、右行走支架的前后安装四个行走轮，前两行走轮的前方安装检测开关，后两行走轮上安装检测开关，四个行走轮的轮轴分别通过万向联轴器连接传动轴，四根传动轴的上端伸入顶部安装箱内，可高效地清洗玻璃温室屋顶的灰尘和青苔等附着物，提高了温室透光率，安全性高。