本发明提供一种电量数据缺失值填补方法和系统，涉及电量数据处理技术领域，所述方法包括：根据电力信息采集系统查找电量数据缺失值对应的时间段；获取不同日期相同时间段的完整数据形成历史数据集；为历史数据集设置缺失值，分别采用不同的缺失值填补方法对历史数据集中的缺失值进行填补；对各缺失值填补方法分别进行验证评估；根据验证评估结果设置各缺失值填补方法的权重；采用上述各缺失值填补方法分别对电量数据缺失值进行填补得到预估值；利用缺失值填补方法的权重和预估值计算电量数据缺失值的填补数据。能够提高缺失值填补的精度，解决电量数据缺失值填补不够准确、填补误差较大、填补效果不理想的问题。