一种基于短核苷酸片段检测抗生素耐药基因的方法
公开
摘要
本发明涉及抗生素耐药基因检测领域，公开了一种基于短核苷酸片段检测抗生素耐药基因的方法，包括以下步骤：获取抗生素耐药基因的基因序列以及细菌菌株的全基因组测序数据，分别进行数据预处理识别核苷酸片段，得到核苷酸序列索引参考数据集C1和比对数据集C2；从参考数据集C1和比对数据集C2中分别获取指定长度的短核苷酸片段参考数据集S1和比对数据集S2；将参考数据集S1和比对数据集S2进行动态匹配；依据动态匹配结果，进行比对率计算；输出抗生素耐药基因检测结果。本发明的方法可以解决全基因组测序结果准确性较低以及抗生素耐药基因数据库的局限性对抗生素耐药基因检测的影响，提高抗生素耐药基因检测的准确率和检出率。
基本信息
专利标题 ：
一种基于短核苷酸片段检测抗生素耐药基因的方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN114596916A
申请号 ：
CN202111616392.0
公开（公告）日 ：
2022-06-07
申请日 ：
2021-12-27
授权号 ：
暂无
授权日 ：
暂无
发明人 ：
应南娇李姗珊邵梦洁马楠
申请人 ：
杭州电子科技大学
申请人地址 ：
浙江省杭州市下沙高教园区
代理机构 ：
杭州杭诚专利事务所有限公司
代理人 ：
何俊
优先权 ：
CN202111616392.0
主分类号 ：
G16B30/10
IPC分类号 ：
G16B30/10 G16B50/30
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B30/00
特别适用于对核酸或氨基酸进行序列分析的ICT
G16B30/10
序列排列；同源搜索
法律状态
2022-06-07 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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