本申请公开了一种GNSS信号切片导航数据的基带处理方法和系统，本方法包括：获取由GNSS卫星发送的导航数据，经处理后得到数字导航数据；经切片处理，得到切片导航数据，并进一步得到频域切片数据；与频域本地数据结合，得到相关积分值，用以判断导航数据是否有效。本系统包括数据采集模块、数据切片模块、频域数据处理模块、数据分析模块；数据采集模块用于得到数字导航数据；数据切片模块用于得到切片导航数据；频域数据处理模块用于得到频域切片数据；数据分析模块用于判断导航数据是否有效。本申请不仅提取出了精确有效的导航数据，而且修复了不完整的导航数据，实现了实时全天候弱信号接收，保障了导航系统的稳定、有效。