本发明公开了一种2,6‑二氯嘌呤的合成方法，包括在反应釜中，首先投入离子液体，搅拌，接着加入浓盐酸，搅拌下继续加入2‑氨基‑6‑氯嘌呤；继续搅拌，加入亚硝酸钠进行反应；反应结束后，用乙酸乙酯萃取得到粗品，甲醇重结晶后得到2,6‑二氯嘌呤白色晶体步骤，通过优选出的氯盐离子液体对于2‑氨基‑6‑氯嘌呤分子具有良好的活化性能，能选择性催化2‑氨基‑6‑氯嘌呤制备得到2,6‑二氯嘌呤，并且会显著抑制偶氮、水解、开环等副反应，从而提高反应选择性和收率，且采用了合理的后处理工艺，大幅度减少三废排放，降低成本。本发明以2‑氨基‑6‑氯嘌呤计的2,6‑二氯嘌呤的收率大于98％，含量大于99％。