本发明提供一种同时考虑行程时间和公平性的交通灯控制方法及系统，其中方法包括：将行程时间策略Q网络的结果值输入至行程时间策略Q网络的交通仿真环境，将公平性策略Q网络的结果值输入至公平性策略Q网络的交通仿真环境，得到每个路口的奖励以及下一步的状态；通过DQN算法，根据行程时间策略Q网络的元组型数据缓存器中的数据对行程时间策略Q网络进行更新，根据公平性策略Q网络的元组型数据缓存器中的数据对公平性策略Q网络进行更新；建立中心Q网络，并将更新完成的行程时间策略Q网络和更新完成的公平性策略Q网络蒸馏至中心Q网络。本发明同时考虑路网中车辆的平均行程时间以及公平性，达到在行程时间相同下，公平性更好的效果。