本发明属于种质评价技术领域，公开了一种芒果种质资源营养品质的评价系统，包括：培养液制备模块、芒果种子培育模块、温度监测模块、温度调节模块、中央控制模块、光照模块、图像采集模块、图像处理模块、图像分析模块、品质评价模块。本发明提供的芒果种质资源营养品质的评价系统利用图像采集模块拍摄种子萌发图片，在处理后的图像的基础上，自动化绘制种子萌发曲线，进行显著性差异比较，提取芒果种子营养品质的相关指标参数，可高通量处理，并获得种子发芽过程的动态指标，提高了种子营养品质评价的效率以及提高评价的科学性。本发明的评价系统结构简单，能够实现对芒果种质资源营养品质的精准、合理评价，为芒果培育提供指导。