本发明属于网络信息安全技术领域，特别涉及一种基于AnoA理论的匿名网络被动流量分析评估方法及系统，该方法包括生成评估过程中要执行的挑战表，确定分析目标集合，将分析目标集合与挑战表共同封装后传递给挑战者；解析出具体的分析目标；挑战者构造与分析目标对应关系的挑战函数；挑战者利用挑战函数规则进行挑战元素分析，结合挑战值、挑战者的匿名网络协议和分析场景，生成对挑战元素变换后的挑战表；攻击者对分析目标和挑战值进行猜测，并利用分析度量评估规则量化分析强度。本发明通过让流量分析攻击者与作为匿名网络的挑战者之间进行“挑战与响应游戏”，并定义了流量分析中的分析属性，较大程度上提高了评估准确性。