本发明提供一种微电机磁瓦转运系统，包括控制系统及分别与其连接的转运机构、单片分离机构，其中：所述转运机构，包括设置于抓取机构下方的送料轨道，该送料轨道用于将磁瓦转运至单片分离机构，所述送料轨道上配置磁瓦推动单元，所述磁瓦推动单元用于推动磁瓦朝向靠近单片分离机构的方向前进并防止磁瓦倾倒；所述单片分离机构，用于从多个磁瓦中分离出单片磁瓦供上料装配使用。该系统通过磁瓦推动单元推动磁瓦前进，实现现快速、稳定的转运磁瓦，同时，单片分离单元可自动实现单片磁瓦的分离，方便后续上料工序。