本发明涉及一种双桨转速、相位同步控制方法及系统。解决了现有螺旋桨转速控制方法无法精确实现双桨速度跟随的一致性及相位差闭环控制的技术问题。本发明方法包括以下步骤：1)获取双桨的转速实际值；2)计算右螺旋桨转速目标值与实际值之间的偏差，改变PWM信号占空比，控制右螺旋桨转速；3)判断右螺旋桨转速目标值与实际值的偏差是否在设定偏差范围内；4)计算双桨转速实际值差值，作为PID控制输入，改变左螺旋桨转速；5)判断双桨转速差值是否在预设偏差范围内；6)计算双桨实际相位差与目标相位差的偏差，采用PID控制，实现相位差控制；7)判断相位差偏差是否在预设相位差范围内。本发明还提供了一种双桨转速、相位同步控制系统。