一种基于孔径合成的叠层强度相干成像方法及设备，方法包括获取被探针整形后的相干光源遍历照射目标物体后形成的散斑图样；对散斑图样进行整合，求得每个相干光源照射区域对应的自相关函数；将自相关函数代入叠层算法中恢复目标图像。本发明还公开了一种基于孔径合成的叠层强度相干成像系统及计算机可读存储介质。本发明基于叠层强度相干成像的系统架构，通过接收光源和目标物体作用后的回波散斑进行目标成像，抗噪能力强。同时受大气湍流扰动和光学系统相差等缺陷影响不明显，具有抗湍流扰动的特性。本发明利用相干光源遍历照射目标物体后形成的散斑图样进行叠层强度相干成像，能突破单个孔径成像系统的孔径限制，实现高分辨率成像。