本发明提供一种安全型芯片烧录方法及系统。一种安全型芯片烧录方法，该方法具体包括以下步骤：校验测试机；读取被测芯片的唯一性信息数据；根据预设加密算法将被测芯片的唯一性信息数据进行加密计算，以得到被测芯片所对应的专属数字证书；通过测试机将专属数字证书烧录于被测芯片。本发明缩短了被测芯片烧录内容的传输环节，使烧录内容通过读取被测芯片的唯一性信息数据后以加密算法计算得到，整个数据传输完全在硬件安全环境进行，避免了跨硬件的公开网路传输，解决了现有技术中烧录内容和被测芯片分别单独分发造成的泄密性问题，具有高安全性和高便捷性，适合批量化生产作业。