本实用新型涉及一种药材控温干燥机构。包括用于干燥药材的烘干箱体、干燥机构以及循环风向系统，所述烘干箱体包括：双腔式箱体，所述双腔式箱体的一侧面开有至少两个呈不规则矩形的烘干腔体，所述双腔式箱体的两侧还开有呈扁平矩形的流动风腔体，所述烘干腔体的两侧与所述流动风腔体连接，所述烘干腔体与烘干腔体之间设置有隔断层，所述隔断层的一侧面还设置有加热板。本实用新型实用性强，能有效解决液体残留或药材干燥状态不良的问题，同时解决烘干机构热量流失的问题。