本实用新型实施例涉及仓储管理技术领域。尤其涉及一种货物传输系统及其自动仓储系统。该货物传输系统包括：若干个操作台，所述操作台设置在第一操作区内，用于处理货物；若干个机器人，所述机器人将货物搬运至所述操作台或者将货物从所述操作台中搬离；输送线，所述输送线连接至每个所述操作台，具有至少一个用于输出货物的货物输出端和至少一个用于接收货物的货物输入端；所述货物输出端位于第二操作区。该传输系统使用延伸至第二操作区的输送线的方式实现货物入库和第二操作区域相互远离，能够减少机器人的数量，在较高的效率要求时具有较低的实现成本。