本实用新型公开了一种畜牧兽医微生物气溶胶采样装置，包括固定座、采样箱和底座，底座的顶部固定安装有采样箱，采样箱的底部固定安装有电机，电机的输出端固定安装有转轴，转轴上分别固定安装有第一扇叶与第二扇叶，采样箱的顶部固定安装有过滤架，采样箱的顶部限位固定有固定座，采样箱一侧的底座上固定安装有取样盒，采样箱另一侧的底座上固定安装有废料箱，废料箱的顶部固定安装有水箱。本实用新型通过第一扇叶与第二扇叶以及采样箱相互配合，方便进行采样，配合第二喷水管进行喷淋进行过滤，提高实用性，通过过滤架与第一喷水管以及固定座相互配合，利用过滤架对颗粒杂质过滤，利用喷头进行冲洗，提高过滤效果。