本实用新型公开了一种畜牧兽医微生物气溶胶采样装置，包括工作箱，工作箱的顶部固定安装有输送箱，输送箱内腔上端的两侧通过支架固定安装有第一电机，第一电机输出端的两侧均固定安装有第一扇叶，输送箱内腔的下端固定安装有过滤网，输送箱内腔的底部固定安装有输送管。本实用新型通过第一电机和第一扇叶的设置，达到了对外界的空气输送至输送箱内的效果，通过过滤网的设置，可以对毛发和杂物进行净化过滤处理，通过输送管的设置，达到了对杂物过滤后的空气输送至喷头内的效果，通过吸热片的设置，达到了对采样箱内进行散热处理的效果，通过第二电机和第二扇叶的设置，达到了对冷气进行均匀分布的效果。