本发明涉及一种畜牧兽医微生物气溶胶采样装置，包括箱体，箱体上设置有一个可开闭的翻盖，且箱体的一侧还转动安装有箱门，箱体的内部通过螺纹驱动机构活动设置有横板，采样器本体安装于横板上，且横板上还设置有用于放置取样瓶的圆盘，圆盘上设置有夹持机构，箱门的门轴同设置在箱体中的从动机构连接，最终，通过箱门的开闭、夹持机构对取样瓶的夹持固定以及采样器本体跟随横板做的直线三者之间的相互联动，使得采样器本体在不使用的情况下能够自动收纳与箱体中，对其起到了有效的防护效果，且夹持机构可将取样瓶固定于圆盘之上，则保证了后续采集过程中取样瓶的稳定，防止了在采集过程中因外物的碰撞而使取样瓶发生倾倒的问题发生。