本实用新型涉及药品防护技术领域，尤其是一种防止药品微生物污染的防护装置，包括顶筒、底筒和内筒，顶筒和底筒分别套设固定在内筒的顶部和底部，顶筒和底筒外侧套设固定有挤压套，挤压套和内筒之间设有复位机构，内筒的上下两端分别设有上封堵机构和下封堵机构，内筒侧壁上固定安装有第一单向阀，第一单向阀的进气端与内筒内部相连通，第一单向阀的出气端贯穿内筒侧壁并延伸进入底筒和内筒之间，底筒侧壁上固定安装有第二单向阀，第二单向阀的进气端与底筒内部相连通，第二单向阀的出气端依次贯穿底筒、挤压套侧壁并延伸出去，该装置能够通过物理方式吸取内筒内部的空气，从而抑制微生物生长。