本申请提供一种仓储调度系统，包括控制服务器、库存区域、至少两种不同的可移动载具、搬运设备、容器装卸设备，库存区域包括可移动货架和其它种可移动载具；控制服务器确定目标可移动货架、其它种目标可移动载具以及目标工作站，确定第一搬运设备、第二搬运设备、目标容器装卸设备，向第一搬运设备发送第一搬运指令，向第二搬运设备发送第二搬运指令，向目标容器装卸设备发送装卸指令；第一搬运设备响应于所第一搬运指令，搬运目标可移动货架到目标工作站；第二搬运设备响应于第二搬运指令，搬运其它种目标可移动载具至目标工作站；目标容器装卸设备响应于装卸指令，从目标可移动货架中取出目标第一容器或将目标第一容器放在目标可移动货架。