本实用新型公开了一种带有分区培养机构的发酵设备，包括设备箱，设备箱的内腔等距连接有若干安装板，安装板的顶部放置有发酵箱，设备箱的两侧均开设有导向槽，导向槽的内腔转动连接有丝杆，丝杆的两端均螺纹连接有套筒，四个套筒的顶部分别与两个夹持板的两端连接，安装板的一边侧开设有传动槽，丝杆靠近传动槽的一端套接有传动轮，设备箱远离传动槽的一端开设有驱动槽，其中一个丝杆的一端穿过导向槽固定连接有从动锥形齿轮，驱动槽的一侧转动连接有转杆，转杆位于驱动槽内腔的一端固定连接有主动锥形齿轮，本实用新型一种带有分区培养机构的发酵设备，通过将发酵设备划分多个培养区域，可以一次培养多种种微生物，提高设备的利用率。