本实用新型涉及溶剂萃取技术领域，具体涉及一种生物医药萃取器；包括萃取罐和清理组件，清理组件包括刮药器和冲洗器，冲洗器包括若干高压喷头、喷水环、输水管和反洗泵，萃取罐萃取完药剂后或对不同药剂萃取时，通过反洗泵连通水源抽取清洁用水，并将水导入输水管内，输水管将水流导入喷水环内，喷水环通过高压喷头将水流加油喷出，清洗粘在萃取罐内的药剂，高压喷头喷水的同时，刮药器在萃取罐内转动刮掉粘在萃取罐内壁上的药剂，进一步加强对残留药剂的清理，最后打开萃取罐将清洗的药剂残渣排出，解决现有萃取罐无清理机构，萃取不同药剂时，残留药剂影响后续萃取效率的问题。