本实用新型公开了新型生物肥高温杀菌装置，包括底座，所述底座上设置有定位槽，所述定位槽内设置有杀菌桶，所述杀菌桶内设置有用于将生物肥加热的内蒸汽管，所述内蒸汽管周围设置有转轴，所述转轴上均设置有用于将内蒸汽管附近的生物肥翻动的翻动杆，所述定位槽内设置有驱动组件，所述驱动组件与翻动杆连接，并带动翻动杆旋转，此新型生物肥高温杀菌装置，区别现有技术，通过翻动杆、内蒸汽管和驱动组件的配合使用，使得在对杀菌桶内的生物肥进行高温杀菌时，翻动杆将内蒸汽管附近最先受热的生物肥进行翻动，能够使得热量在杀菌桶内均匀传递，大大的节省了高温灭菌的时间，同时也提高了工作效率。